تعمل المؤسسة على
1 - ادارة واستثمار المناطق الحرة واحداث المستودعات والمخازن اللازمة لها وتطويرها بما يؤدي الى نمو هذه المناطق وازدهارها.
2 - اقتراح مشاريع انشاء المناطق الحرة الجديدة والغاؤها .
3 - تنظيم أعمال المناطق الحرة وتنسيق فعاليتها بما يؤدي لخدمة الاقتصاد وتنمية المبادلات التجارية الدولية وبصورة عامة معالجة كل ما يتعلق بإدارة المناطق الحرة واستثمارها .

والمنطقة الحرة هي جزء من الأرض الوطنية محدد ومسور ومعزول عن المنطقة الجمركية بحيث تعتبر في حكم الأرض الأجنبية بالنسبة لأحكام التجارة الخارجية والقطع والحواجز الجمركية . تسري عليها الأنظمة والقوانين المتعلقة بالأمن والأداب والصحة العامة وقمع التهريب وتبعاً لذلك فإن البضائع والسلع تدخل اليها بحرية تامة معفاة من الرسوم الجمركية والضرائب وبمعزل عن القيود والأنظمة الاقتصادية السارية داخل القطر وبالتالي تستورد الى المناطق الحرة كافة البضائع ويجري اعادة تصديرها الى البلدان الأجنبية والعربية بحرية تامة . أما عند ادخال البضائع الى داخل القطر العربي السوري فتخضع للقوانين والأنظمة النافذة فيه .

أحدثت المؤسسة العامة للمناطق الحرة بموجب المرسوم التشريعي رقم /18/ لعام 1971 وصدق نظام الاستثمار فيها بموجب المرسوم رقم /84/ لعام 1972