يتولى مجلس الامناء المسؤوليات والصلاحيات التالية :" أ) دعم استقلال الجامعة وصيانته واتخاذ جميع الوسائل المؤدية الى رفع شأنها وتمكينها من اداء رسالتها وتحقيق اهدافها . ب) تدبير موارد الجامعة وتنظيم استثمار اموالها . جـ) مناقشة واقرار مشروع الميزانية السنوية . د) مناقشة واقرار الانظمة الداخلية الخاصة المتعلقة بالامور المالية والاسكانية التي يقترحها مجلس الجامعة . هـ) تنسيب شخص او اكثر لرئاسة الجامعة ويتم التعيين بارادة ملكية سامية . و) تعيين نواب الرئيس والعمداء ومديري المستشفيات بناء على تنسيب من رئيس الجامعة على أن يقترن التعيين بالارادة الملكية السامية." بحسب نص القانون.

تعمل الجامعة الاردنية بموجب قانون الجامعة الاردنية لسنة 1972 وتعديلاته في القانون المعدل رقم 24 لسنة 1981 والقانون المعدل رقم 27 لسنة 1985

للجامعة مجلس امناء "يتألف من ثمانية عشر عضوا من ذوي الرأي والخبرة يكون ثلثاهم على الاقل من الاردنيين ويكون رئيس الجامعة واحدا منهم بحكم منصبه ". و"يعين الملك اعضاء مجلس امناء الجامعة ويعين من بينهم رئيس مجلس الامناء ويقيلهم ويقبل استقالاتهم ." ويتم تعيين الاعضاء "غير الاردنيين في الوقت الذي يرتأيه الملك" بحسب قانون الجامعة. ويكون تعيين اعضاء مجلس امناء الجامعة لمدة ست سنوات قابلة للتجديد .

لمجلس الامناء، بالاضافة الى صلاحياته، ان يجمع اكثر من كلية في هيئة واحدة على ان تحدد تسمية هذه الهيئة وتشكيلاتها وصلاحياتها وعضويتها في مجالس ولجان الجامعة بنظام يصدر لهذه الغاية