يرأس أمانة مركز دبي للتحكيم الدولي أمين عام يباشر عمله من خلال فريق عمل الأمانة و المكون من قانونيين واداريين يتميزون بالخبرة و الكفاءة. وتقوم الأمانة بمهمة تسجيل طلبات التحكيم التي تردها و تقديم المساندة القانونية التي يحتاجها المحكمين الأفراد أو هيئات التحكيم، عبر القيام بدورها كقناة وصل رسمية بين الأطراف كما تحرص على حفظ المستندات المؤتمنة بعهدتها بواسطة الوسائل التقليدية المعروفة إلى جانب آخر ما توصلت اليه التكنولوجيا الالكترونية. توفر الأمانة خدمات الأبحاث القانونية و الترتيبات المالية و المساندة التقنية و المادية المطلوبة، وتنظم عقد الاجتماعات و جلسات الاستماع بالاضافة الى ترتيب الحجوزات و كافة أعمال السكرتارية العامة الأخرى. تتولى أمانة المركز توفير المعلومات و المشورات للأطراف الراغبين في التوفيق أو التحكيم.